PCサイトの場合、シェア的にはWindowsユーザーが多いため、私はデフォルトのメイリオではなく「Notoフォント」を使用することが多いです。
その一方で、モバイル端末のスマホサイトの場合、iPhoneユーザーのシェアが多く、この場合はサファリになるため、綺麗に表示される「ヒラギノ角ゴ ProN W3」を使うことができます。
この「Noto」と「ヒラギノ」を天秤にかけた場合、フォントの美しさという点では互角か、もしくはわずかに「ヒラギノ」に軍配が上がると感じています。そのため、あえて転送量が大きくなるWEBフォントの「Noto」をモバイル端末向けに使用する必要性はないと考えており、モバイル端末ではWEBフォントを無効にしています。
大手サイトを閲覧しても、おおむねWEBフォントは使用されていないことが多く、基本的にはメイリオが使用されています。個人サイト等でWEBフォントを使用しているケースも多いですが、それがかえって読みにくくなっているのではないかと感じることもあります。
そのため、個人的にはサイトでWEBフォントを使用する必要はないと感じており、モバイルサイトでは上記の理由でなおさらないと考えてますが、もし使用するなら、PCサイトでのみ表示されるようにするとよいでしょう。
フォント専用のCSSを作成し、 media="screen and (min-width:480px)">などと指定して、PCサイトでのみ読み込む形にすると最適化できると思います。